Considérées comme perdues depuis plusieurs siècles, ces 57 missives étaient conservées, mais mal cataloguées, dans les archives de la Bibliothèque nationale de France. L'enquête est menée par un trio international de cryptographes amateurs qui a annoncé sa découverte début 2023. L'équipe se compose de Satoshi Tomokiyo, un astrophysicien japonais passionné de codes secrets, George Lasry, un informaticien franco-israélien et Norbert Biermann, un professeur de musique allemande. C'est Satoshi Tomokiyo qui a initié l'enquête en découvrant par hasard les documents sur le site de la BnF en 2021. Le film du réalisateur Augustin Viatte suit en parallèle le destin tragique de la reine et l'aventure intellectuelle de ces “casseurs de code” . Travaillant à distance et sur leur temps libre, ils sont venus à percer un code homophonique complexe de près de 200 caractères différents, en combinant des logiciels d'intelligence artificielle et des méthodes manuelles.

Rédigées en moyen français entre 1578 et 1584, ces lettres révèlent une Marie Stuart politique et stratège, loin de la simple figure romanesque et tragique. La correspondance, authentifiée par l'historien britannique John Guy, montre ses efforts pour négocier sa libération, maintenir son réseau d'alliés, se plaindre de ses conditions de détention ou encore peser sur les rivalités dynastiques européennes. Qualifiée de découverte la plus importante sur Marie Stuart depuis un siècle, elle offre un regard nouveau sur les intrigues politiques et religieuses de l'époque. Le documentaire présente des reconstitutions historiques,  des interventions d'historiens et le témoignage des trois décrypteurs.

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